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如果您的苹果手机显示有新短信提示，但是在短信应用中看不到新信息，可能有以下几种原因。
1、未读短信被标记为已读：有时在锁屏状态下，您可能不小心滑动或通过其他方式将未读短信标记为已读，导致您看不到新信息，您可以尝试进入短信应用并刷新界面，查看是否有未读短信。
2、短信应用出现错误或崩溃：有时短信应用可能会出现错误或崩溃，导致无法正确显示新信息，您可以尝试关闭短信应用并重新打开，或者重新启动手机来解决问题。
3、短信被拦截或过滤：如果您的手机设置了拦截或过滤未知号码或垃圾短信，可能会导致新短信无法显示，您可以检查您的拦截列表或过滤设置，确保新短信没有被误判。
4、信号问题或网络延迟：如果您的手机信号不稳定或存在网络延迟，可能会导致短信接收延迟或无法接收新信息，您可以尝试移动到信号更好的地方，或者等待一段时间再次查看短信应用。
如果以上方法都无法解决问题，建议您尝试重置手机网络设置或联系苹果官方客服寻求帮助，确保您的手机系统版本和短信应用版本都是最新的，以避免因软件版本过旧而导致的问题。